Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAVIN3Q969G5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms