Protein–RNA interactions for Protein: Q92834

RPGR, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRQ92834 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPGRQ92834 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPGRQ92834 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms