Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TNRQ92752 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TNRQ92752 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNRQ92752 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNRQ92752 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNRQ92752 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNRQ92752 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNRQ92752 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNRQ92752 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNRQ92752 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNRQ92752 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNRQ92752 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNRQ92752 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNRQ92752 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNRQ92752 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNRQ92752 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNRQ92752 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNRQ92752 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNRQ92752 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNRQ92752 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNRQ92752 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNRQ92752 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNRQ92752 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNRQ92752 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNRQ92752 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TNRQ92752 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TNRQ92752 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNRQ92752 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNRQ92752 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNRQ92752 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNRQ92752 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNRQ92752 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNRQ92752 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TNRQ92752 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TNRQ92752 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TNRQ92752 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
TNRQ92752 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TNRQ92752 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNRQ92752 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNRQ92752 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNRQ92752 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNRQ92752 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNRQ92752 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNRQ92752 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNRQ92752 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNRQ92752 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TNRQ92752 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNRQ92752 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNRQ92752 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNRQ92752 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TNRQ92752 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TNRQ92752 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNRQ92752 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNRQ92752 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNRQ92752 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TNRQ92752 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNRQ92752 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TNRQ92752 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNRQ92752 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNRQ92752 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNRQ92752 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNRQ92752 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNRQ92752 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNRQ92752 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNRQ92752 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNRQ92752 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNRQ92752 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNRQ92752 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNRQ92752 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNRQ92752 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNRQ92752 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNRQ92752 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNRQ92752 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNRQ92752 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNRQ92752 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNRQ92752 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNRQ92752 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNRQ92752 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNRQ92752 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNRQ92752 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNRQ92752 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNRQ92752 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNRQ92752 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNRQ92752 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNRQ92752 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNRQ92752 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNRQ92752 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TNRQ92752 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNRQ92752 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNRQ92752 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TNRQ92752 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNRQ92752 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TNRQ92752 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TNRQ92752 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNRQ92752 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNRQ92752 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNRQ92752 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNRQ92752 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNRQ92752 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNRQ92752 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms