Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC33■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
TOPBP1Q92547 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms