Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113Q902F9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms