Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms