Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
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ZNF548Q8NEK5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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ZNF548Q8NEK5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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ZNF548Q8NEK5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF548Q8NEK5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF548Q8NEK5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF548Q8NEK5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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