Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC191Q8NCU4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms