Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms