Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAS9

C5orf17, Uncharacterized protein C5orf17, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf17Q8NAS9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
C5orf17Q8NAS9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C5orf17Q8NAS9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C5orf17Q8NAS9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C5orf17Q8NAS9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C5orf17Q8NAS9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C5orf17Q8NAS9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C5orf17Q8NAS9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C5orf17Q8NAS9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
C5orf17Q8NAS9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C5orf17Q8NAS9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C5orf17Q8NAS9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C5orf17Q8NAS9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C5orf17Q8NAS9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C5orf17Q8NAS9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C5orf17Q8NAS9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C5orf17Q8NAS9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C5orf17Q8NAS9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C5orf17Q8NAS9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C5orf17Q8NAS9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C5orf17Q8NAS9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms