Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms