Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms