Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC9A9Q8IVB4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC9A9Q8IVB4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC9A9Q8IVB4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC9A9Q8IVB4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC9A9Q8IVB4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC9A9Q8IVB4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A9Q8IVB4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A9Q8IVB4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A9Q8IVB4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A9Q8IVB4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A9Q8IVB4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A9Q8IVB4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A9Q8IVB4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A9Q8IVB4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A9Q8IVB4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A9Q8IVB4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A9Q8IVB4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A9Q8IVB4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A9Q8IVB4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A9Q8IVB4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A9Q8IVB4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A9Q8IVB4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A9Q8IVB4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A9Q8IVB4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A9Q8IVB4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A9Q8IVB4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms