Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRX1Q86UT6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms