Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT28Q7Z3Y7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms