Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM5Q71RC9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms