Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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