Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPTE2Q6XPS3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPTE2Q6XPS3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms