Protein–RNA interactions for Protein: Q6VMQ6

ATF7IP, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7IPQ6VMQ6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF7IPQ6VMQ6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF7IPQ6VMQ6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF7IPQ6VMQ6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF7IPQ6VMQ6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF7IPQ6VMQ6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF7IPQ6VMQ6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF7IPQ6VMQ6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF7IPQ6VMQ6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF7IPQ6VMQ6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF7IPQ6VMQ6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF7IPQ6VMQ6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF7IPQ6VMQ6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF7IPQ6VMQ6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF7IPQ6VMQ6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF7IPQ6VMQ6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF7IPQ6VMQ6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF7IPQ6VMQ6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms