Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms