Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMCO3Q6UWJ1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
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