Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCD3Q6STE5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms