Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms