Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LCN10Q6JVE6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LCN10Q6JVE6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LCN10Q6JVE6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LCN10Q6JVE6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LCN10Q6JVE6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LCN10Q6JVE6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LCN10Q6JVE6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LCN10Q6JVE6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LCN10Q6JVE6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LCN10Q6JVE6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LCN10Q6JVE6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LCN10Q6JVE6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LCN10Q6JVE6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LCN10Q6JVE6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LCN10Q6JVE6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LCN10Q6JVE6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LCN10Q6JVE6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LCN10Q6JVE6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LCN10Q6JVE6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LCN10Q6JVE6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LCN10Q6JVE6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LCN10Q6JVE6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LCN10Q6JVE6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LCN10Q6JVE6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms