Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPPQ6IPU0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms