Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCTP1Q6DN14 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms