Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms