Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms