Protein–RNA interactions for Protein: Q66PJ3

ARL6IP4, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL6IP4Q66PJ3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL6IP4Q66PJ3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL6IP4Q66PJ3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms