Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
C9orf84Q5VXU9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
C9orf84Q5VXU9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
C9orf84Q5VXU9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
C9orf84Q5VXU9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
C9orf84Q5VXU9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
C9orf84Q5VXU9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
C9orf84Q5VXU9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
C9orf84Q5VXU9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
C9orf84Q5VXU9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
C9orf84Q5VXU9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
C9orf84Q5VXU9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
C9orf84Q5VXU9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
C9orf84Q5VXU9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
C9orf84Q5VXU9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
C9orf84Q5VXU9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
C9orf84Q5VXU9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
C9orf84Q5VXU9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
C9orf84Q5VXU9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
C9orf84Q5VXU9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
C9orf84Q5VXU9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
C9orf84Q5VXU9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
C9orf84Q5VXU9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
C9orf84Q5VXU9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
C9orf84Q5VXU9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
C9orf84Q5VXU9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
C9orf84Q5VXU9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
C9orf84Q5VXU9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
C9orf84Q5VXU9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
C9orf84Q5VXU9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
C9orf84Q5VXU9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
C9orf84Q5VXU9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms