Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms