Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms