Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BEND3Q5T5X7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BEND3Q5T5X7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BEND3Q5T5X7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BEND3Q5T5X7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BEND3Q5T5X7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BEND3Q5T5X7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BEND3Q5T5X7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BEND3Q5T5X7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BEND3Q5T5X7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BEND3Q5T5X7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BEND3Q5T5X7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BEND3Q5T5X7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BEND3Q5T5X7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BEND3Q5T5X7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BEND3Q5T5X7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BEND3Q5T5X7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BEND3Q5T5X7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BEND3Q5T5X7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BEND3Q5T5X7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BEND3Q5T5X7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BEND3Q5T5X7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BEND3Q5T5X7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BEND3Q5T5X7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms