Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0N1

CFAP70, Cilia- and flagella-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP70Q5T0N1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms