Protein–RNA interactions for Protein: Q5NUL3

FFAR4, Free fatty acid receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR4Q5NUL3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms