Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms