Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF6

HSP90AB4P, Putative heat shock protein HSP 90-beta 4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB4PQ58FF6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HSP90AB4PQ58FF6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HSP90AB4PQ58FF6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HSP90AB4PQ58FF6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HSP90AB4PQ58FF6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HSP90AB4PQ58FF6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HSP90AB4PQ58FF6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HSP90AB4PQ58FF6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HSP90AB4PQ58FF6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HSP90AB4PQ58FF6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms