Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms