Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PKDCCQ504Y2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PKDCCQ504Y2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PKDCCQ504Y2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PKDCCQ504Y2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PKDCCQ504Y2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PKDCCQ504Y2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PKDCCQ504Y2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PKDCCQ504Y2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PKDCCQ504Y2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PKDCCQ504Y2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDCCQ504Y2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDCCQ504Y2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDCCQ504Y2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDCCQ504Y2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDCCQ504Y2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDCCQ504Y2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDCCQ504Y2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDCCQ504Y2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDCCQ504Y2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDCCQ504Y2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDCCQ504Y2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDCCQ504Y2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDCCQ504Y2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDCCQ504Y2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDCCQ504Y2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDCCQ504Y2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDCCQ504Y2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDCCQ504Y2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDCCQ504Y2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDCCQ504Y2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDCCQ504Y2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKDCCQ504Y2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms