Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms