Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP13-3Q3SY46 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms