Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms