Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC57Q2TAC2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC57Q2TAC2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms