Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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