Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
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