Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PCSK7Q16549 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
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PCSK7Q16549 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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PCSK7Q16549 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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PCSK7Q16549 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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PCSK7Q16549 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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PCSK7Q16549 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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PCSK7Q16549 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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PCSK7Q16549 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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