Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
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