Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIP4Q15650 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIP4Q15650 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms