Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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