Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCEA2Q15560 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms